《特『刀劍亂舞-花丸-』～雪之卷～》具有大棵萬葉櫻的本丸，正處於白雪覆蓋前夕──。刀劍男士大和守安定和加州清光聊起往事。當時有把刀收到時之中央政府的命令，被派出到他們這個本丸，自稱為名刀山姥切的本歌，名叫“山姥切長義”。 山姥切長義對自己的仿作“山姥切國廣”擺出激怒的立場，山姥切國廣對他的想法也很簡單。加州清光察覺到他們倆的心結，一忘了要協助夥伴；大和守安定顯現出加州清光的堅強意志，於是向他提出一個提議。

另一方面，本丸忽然收到電話，這次的特命是去調查“歷史被轉變，被退出的全世界”。出陣的目的地是江戶幕府中期，文久三年的土佐。身為阪本龍馬佩刀的陸奧守吉行兼任副隊長，五名刀劍男士動身前往歷史被轉變的土佐。然而那處的街道景象，和陸奧守吉行所告訴的土佐幾乎有所不同。一夥人和先行前往調查的肥前忠廣和南海次郎朝尊進發，然後四處奔走，征討轉變歷史的主使。